分子蒸馏器的分子蒸馏是一种特殊的液液分离技术。它不同于传统蒸馏的沸点差分离原理，而是通过不同物质分子运动的平均自由程的差异来分离。

       当液体混合物沿着加热板流动并被加热时，轻分子和重分子将从液体表面逸出并进入气相。随着轻、重分子自由程的不同，不同物质分子从液面逸出后，移动距离不同。如果可以适当地设置冷凝板，轻分子到达冷凝板进行冷凝和排放。重分子不能到达凝结板并沿混合物排出。这样，就达到了材料分离的目的。

       沸腾膜与冷凝表面之间的压力差是蒸汽流动的驱动力，而小的压降将导致蒸汽流动。低于1MbR的操作需要在沸腾表面和冷凝表面之间很短的距离。基于这一原理的蒸馏器称为短距离蒸馏。短距离蒸馏（分子蒸馏）具有与加热表面相对的内部冷凝器，并将操作压力降低到0.00毫巴。

        分子蒸馏器的蒸馏过程是：从蒸发器顶部添加物料。转子上的液体分布器均匀均匀地分布在加热面上，刮板被刮成薄层液状液膜，螺旋形向下推。在这个过程中，从加热表面逸出的轻分子通过短路径冷凝成液体，几乎不接触到内置的冷凝器，并沿着冷凝器管流通过位于蒸发器底部的排出管排出；残余液体。收集在加热通道下的圆形通道，然后通过侧出口管流出。